La nascita ufficiale dell’Università di Pisa risale al 3 settembre 1343 quando Papa Clemente VI, con la bolla “In supremae dignitatis” emessa a Villanova presso Avignone, concesse allo Studio Pisano il riconoscimento di Studio Generale dotato degli insegnamenti di teologia, diritto canonico e civile, medicina “et qualibet alia licita facultate”. Nel 1355 seguì il diploma di riconoscimento dell’imperatore Carlo IV.
Con l’avvento della legge 9 maggio 1989 n. 168, è stata riconosciuta l’autonomia universitaria (normativa, amministrativa, finanziaria e didattica) e l’Università di Pisa ha adottato un proprio Statuto e propri Regolamenti. A seguito della Riforma Gelmini l’Ateneo Pisano sta vivendo un periodo di profondo cambiamento, a cominciare dall’adozione del nuovo Statuto e dal nuovo assetto che ha visto la nascita di venti nuove strutture Dipartimentali.